In der Historischen Arbeitsstelle des Museum für Naturkunde lagert eine umfangreiche Sammlung an historischen Schriften, Dokumenten, Nachlässen, Bildmaterial und biologischen Modellen. Als einmalige Quelle für die Geschichte der am Museum vertretenen Fachdisziplinen beinhaltet die Sammlung eine Vielzahl an Briefen, Sammellisten, Skizzenheften sowie Aufzeichnungen, Zeichnungen und Fotos von Forschungsreisen und Expeditionen. Die Mehrzahl stammt aus der Zeit, als das Museum Teil der heutigen Humboldt-Universität war (1889-2008).